Japon akçaağaçları antraknoz, verticillium solgunluğu, katran lekesi, yaprak lekesi, yaprak kavurması ve kök çürüğü gibi hastalıklara karşı hassastır. Bu hastalıkların bazıları ölümcül, bazıları ise genellikle zararsız yalnızca kozmetik.
Verticillium solgunluğu, Japon akçaağaç hastalıklarının en tehlikelilarından biridir. Toprakta yaşayan mantarların neden olduğu kökleri yok etmek çok zor. Mantar, ağaca köklerinden saldırır, bazen ağacın bir tarafını etkiler, diğerini sağlam bırakır. Verticillium solgunluğu toksinler üretirken su akışını engeller. Kahverengi kenarları olan yapraklar normalden daha küçük büyür, sonra solgunlaşır ve düşer. Sonunda ağaç ölür. Bazı ağaçlar etkilenen uzuvlar budandığında iyileşir. Hastalığı önlemenin en iyi yolu, alana ekmeden önce mantar için toprağı test etmektir.
Antraknoz önce yapraklarda kahverengi lekeler olarak görülür. Sonunda ağaç dalları ve gövdesi üzerinde kanserler geliştirir. Bunlar, ağacı saran ve bazen onu öldüren ölü bölgeler. Antraknoz da bir mantardan kaynaklanır, ancak zarar görmüş yaprakların toplanması, döllenmesi, sulanması ve mantar ilacının uygulanması ağacın iyileşmesine yardımcı olmak için etkili adımlardır.
Kök çürüklüğü renksiz yapraklara, kansere ve bodur büyümeye neden olur ve sonunda ölümcül olabilir. Katran lekesi, yaprak lekesi ve yaprak kavurması yaprakların görünümünü etkileyen ancak ağaca zararlı olmayan hastalıklardır. Düşen yapraklar tırmıklamak ve mantar ilaçlarıyla ilaçlamak bu hastalıkların kontrolüne yardımcı olur.
