Dünyanın en soğuk yerinde yaşayan bir imparator penguen, ilk savunma hattı olarak kalın tüy katmanlarına sahiptir. Ayaklar ve kanatların alt kısımları haricinde, ölçek benzeri ve su geçirmez tüyler, penguenlerin tüm gövdesini kaplar ve donmakta olan Antarktika havasından yalıtım ve koruma sağlar.
Kutup bölgesindeki sıcaklıklar kışın düştü ve imparator penguenler, vücut ısısını korumak ve paylaşmak için kaplumbağa oluşumu adı verilen büyük topaklarda bir araya gelerek sert mevsimde hayatta kalır. Kaplumbağa oluşumunda sıcaklık 20 dereceye kadar ulaşabilir. Diğer bölgesel penguenlerin aksine, imparator penguenler grup olarak birlikte çalışır. Arkadaşlarının göbeğindekiler kendilerini ısıttıklarında, oluşum kenarlarındaki kuşların merkeze girmesine izin vermek için taşınırlar.
Penguenler'in ana yırtıcıları leopar fokları ve katil balinalardır. Ayaklarını ve çevikliklerini hızlı yüzmek ve katil balinalar tarafından tehdit edildiğinde toprağı aramak için kullanırlar. Genellikle leopar foklarından kaçınırlar ve yenmekten kaçınmak için bir grupta kalmaya çalışırlar. Bir tür deniz kuşu olan Skuas, penguen yumurtalarına ve yenidoğan kuşlara düşkündür. Yetişkin penguenler, yumurtalarını ayaklarının altına sokarak ya da diğer penguenlerle bir halka oluşturarak, yumurtaların ve gençlerin etrafında koruma sağlamak için korur.
