Güney kolonilerinin çok farklı dinleri vardı, ancak öncelikle Anglikalılar ya da Vaftizcilerdi. Orta kolonilerin Katolikler, Yahudiler ve Quakerleri de içeren pek çok farklı dinleri vardı.
Kolonilerin orijinal yasaları insanları bir kiliseye katılmaya ve kiliselerin ücretini ödemeye yardımcı olan vergileri ödemeye zorladı. Daha sonra sömürgecilerin dini açıdan daha hoşgörülü olmaya ve kiliseyi devletten ayırmaya karar vermeleriydi. İlginç bir şekilde, tüm önemi nedeniyle, kilise ve devletin ayrılması açıkça Birleşik Devletler Anayasası dahil olmak üzere kurucu yasaların hiçbirine yazılmamıştır. "Kilise ve devlet ayrılığı" fikri ilk olarak, Virginia’daki Baptistler bölgede yaşayan Anglikanlara dini hoşgörü göstermek istediğinde ortaya çıktı.
