Bir farenin ciğerlerinin temel işlevi nefes almayı desteklemektir. Solunum, havanın burun veya ağızdan vücuda girdiği, trakeadan ve akciğerlerin bronşlarına girdiği solunum yoluyla gerçekleştirilir. .
Bronşların küçük dalları olan alveoller, hücresel düzeyde gaz değişimi yapmak için özel olarak tasarlanmıştır. Alveollerdeki oksijen kan dolaşımına difüzyon yoluyla girer ve karbondioksit akciğerlere girer. Bu karbondioksit sıçan dışarı çıktığında atılır.
Akciğerler kaburgalar ve kas diyaframı ile çevrilidir. Diyafram, inspirasyon sırasında büzüşür, negatif basınç oluşturur ve ciğerlere hava çeker. Diyafram gevşerse, son kullanım süresi oluşur.