Bir maymunun sahip olduğu kromozom sayısı, maymun türüne bağlıdır. Rhesus maymunu 42 kromozom varken, Capuchin maymunu 54 kromozom varken sincap maymunu 44'dür. İpeksi marmoset gibi maymunlarda insanlarla aynı sayıda kromozom olan 46 kromozom vardır.
Bütün Büyük Maymun türlerinin insanlardan bir çift daha olan 48 kromozom vardır. Hem maymunlar hem de Büyük Maymunlar cinsel olarak ürerler ve onlara Haploid ve Diploid numarası verirler. Haploid numarası, Diploid numarasının yarısıdır. Bir seks hücresinde bulunan kromozomların sayısı veya kromozom çiftlerinin sayısıdır. Diploid numarası, bir yumurta hücresi veya bir sperm hücresi olmayan bir hücredeki kromozomların sayısıdır.