Harmony Science Academy'ye göre, kontrollü bir deney, bir hipotezin tek bir değişkenin manipülasyonuyla test edildiği deneydir. Manipüle edilen değişkenden kaynaklanan değişiklik, yönlü sebep ve sonuç yoluyla nedensellik sağlar. .
Manipülasyona tabi bir deneyin bileşenine bağımsız değişken denir. Kontrollü bir deneyde, araştırmacı manipülasyon gerçekleştiğinde, değişmeyen, bağımlı değişken olarak adlandırılan bileşenin cevabını gözlemleyecekti. Örneğin, çocukların ödüllendirildiğinde daha işbirlikçi olduğu varsayılırsa, araştırmacı ilk önce ödül almadan işbirliği seviyelerini gözlemler ve ardından bir ödül alındıktan sonra etkilerini not eder. Çocuklar daha kooperatifleşirse, araştırmacı hipotezini destekler. Bunun nedeni, bağımsız değişken tanıtıldıktan sonra nedensellik gözlemlenebilir olmasıdır.
