"Bayan Pacman" ve "Pacman" arasındaki farklardan bazıları, dört oyun labirentinden üçüne ekstra bir çift warp tüneli eklenmesini içerir. Ayrıca, labirentlerin kendisi orijinal "Pacman" oyunlarından farklı.
"Ms. Pacman" oyunlarında, hayaletlerin davranış kalıpları "Pacman" 'dan farklıdır ve ayrıca hayaletlerin hareketlerine rastgele bir öğe içerir. Bu, oyuncuların hayaletlerin hareket ettiği kalıpları ezberlemesini önler ve oyunu "Pacman" dan biraz daha zorlaştırır.
Oyunda Meyveler de farklı davranır. Haritanın merkezinde ortaya çıkmak yerine, "Bayan Pacman" daki meyveler, labirentte rastgele bir şekilde sekerek her labirentteki çözgü tünellerine girip çıkıyor. Ek olarak, her meyveye rastlandıktan sonra rastgele bir şekilde yumurtlarlar. Bu, 8. turda başlar.
Ayrıca, Pacman’ın ölüm animasyonunda da değişiklikler yapıldı. Kendisine katlanmak ve Pacman gibi yok olmak yerine, Bayan Pacman ne zaman bir hayalete dokunduğunda etrafta döner. Öldürülmesinin ses efektleri de değişmiş, oyunda diğer seslerin çoğunda olduğu gibi.
"Ms. Pacman" alt rutinlerinde, oyunun 256. turdan sonra oynanamaz hale gelmesine neden olan bir hata yaptı. Bununla birlikte, oyun sırasında çok daha fazla sayıda böcek ortaya çıkmakta ve oyuncunun öykünme kullanmadan 256. seviyeye ulaşması pek mümkün görünmemektedir.
