Baş ağrıları birincil veya ikincil olarak sınıflandırılır ve birincil baş ağrıları, kafada ağrıya duyarlı yapılardaki sorunlardan kaynaklanır. İkincil baş ağrılarına, altta yatan tıbbi durumlardan herhangi biri neden olur. Bu durumlarda, tıbbi durum genellikle baştaki sinirlere basan ve baş ağrısını tetikleyen bir tür şişmeye neden olur.
Birincil baş ağrıları en sık görülen türdür. Küme baş ağrıları, migren ve gerginlik baş ağrıları birincil baş ağrıları olarak sınıflandırılır. Primer baş ağrısının daha az yaygın biçimleri öksürük baş ağrıları, cinsiyet baş ağrıları, kronik günlük baş ağrıları ve egzersiz baş ağrılarıdır. Stres, zayıf duruş, alkol tüketimi, uykusuzluk ve atlanan yemekler bazı insanlarda primer baş ağrısı ile bağlantılı olmuştur.
Farklı şartlarda onlarca ikincil baş ağrısına neden olur. Spinal baş ağrıları, düşük beyin omurilik sıvısı seviyesine sahip olduğunda ortaya çıkar ve sinüs baş ağrıları, sinüs boşluklarının iltihaplanmasıyla ilişkilidir. Sekonder baş ağrıları ayrıca inme, sarsıntı, glokom, grip, menenjit ve diş problemleriyle de ilişkilidir. Dondurma baş ağrıları bir tür ikincil baş ağrısı olarak kabul edilir, çünkü dondurma baş ağrıları soğuk bir şey ağzın çatısına dokunduğunda meydana gelir, kafasına ne kadar kan akacağını belirleyen sinirlerin bir kısmını etkiler. Sonuç olarak, kafadaki kan damarları şişer ve bir yerden beş dakikaya kadar sürebilen baş ağrısı ile sonuçlanır.