Kel kartallar, genellikle dört veya beş yaş civarında olmak üzere, cinsel olgunluk yaşına ulaştıklarında cinsel üremeyi kullanarak ürerler. BaldEagle■ 'ya göre, birçok hayvanın aksine, kel kartallar kuşlardan biri ölmediği sürece yaşam için eşleşir.
Kel kartal cinsel olgunluğa ulaştığında, eş aramaya başlar. İki kuş eşleşince, yuvayı hem inşa eder hem de korurlar. Bir kartal yuvası veya anten, silindirik, konik, disk şekilli ve çanak şeklindeki yuvalar dahil olmak üzere konumuna göre çeşitli şekillerde olabilir. Bu yuvalar genellikle ağaçlar veya uçurumlar gibi yüksek yerlerde nehirler veya kıyılar boyunca inşa edilir.
Aerie yapıldıktan sonra kel kartal eşleşir. Çiftleşme mevsimi boyunca, kartallar talonsları birbirine kilitlenmiş halde havada sarkarken görülür. Uzmanlar, bunun bölgesel bir kartal ile davetsiz misafir arasında bir ritüel veya ritüelleştirilmiş bir savaş olup olmadığından emin değil. Genellikle kel kartal üremesi ile karıştırılır, ancak değildir.
Kel kartal üremesi yuvaya yakın bir yerde veya yerde olur. Kel kartallar 30 yıla kadar yaşayabilir, bu yüzden sürekli üremeleri gereksizdir.
Dişi, çiftleşmeden beş ila 10 gün sonra bir ila üç yumurta bırakır. Bu yumurtalar aynı anda değil, farklı günlerde serilir. Oradan yumurtalar, erkeklerle dişiler arasında sorumluluğun paylaşıldığı 35 günlük bir kuluçka süresine sahiptir. Daha sonra yumurtalar koyuldukları sırayla açılırlar.