Allellerin ayrılması, Mendel'in Ayrılma Yasasını ifade eder. Mendel'in Ayrılma Yasası, alel çiftlerinin gamet oluşumu ve reform sırasında döllenme sırasında rastgele ayrıldığını belirtir.
Bütün diploid organizmaların DNAlarındaki her genin iki kopyası vardır. Bu gen kopyaları aleller olarak adlandırılır ve dizilişlerinde birbirlerinden biraz farklı olabilirler. Mendel genetiğine göre, genotip olarak da bilinen bu alellerin kombinasyonu, bir organizmaya fenotipik veya dış niteliklerini veren şeydir.
Her bir ebeveynden gelen her bir allel çifti, yumurta ve sperm hücrelerinin oluşumu sırasında ayrılır. Mayozis adı verilen bu işlem, her bir alelin sadece bir kopyasını içeren haploid yumurta ve sperm hücrelerinin oluşmasına neden olur.
Döllenme sırasında, haploid yumurta ve sperm hücreleri rastgele birleşerek her bir gen için birer ebeveynden birer tane olmak üzere her gen için iki alel ile yeni diploid hücreler oluşturur. Bu rastgele olduğu için, bir ebeveynden belli bir alel alma şansı yüzde 50'dir. Bu nedenle, bir organizma, özellik başına rastgele eşleştirilmiş iki alel veya her bir ebeveynden bir alel alır.
Organizmada görüntülenen son fenotip, hangi alel dominant olduğuna bağlıdır. Örneğin, kahverengi göz rengi, büyük bir "B" ile gösterilen baskın bir özellikse ve mavi göz rengi, küçük bir "b" harfi ile gösterilen resesif bir özellik, her alelinin bir kopyasına sahip bir organizma veya genotip " Bb ", kahverengi gözlere sahip olmalı. Bu organizmanın yumurta veya sperm hücreleri, yüzde 50 "B" hücreden ve yüzde 50 "b" hücreden ödün vermiştir. Yavruların fenotipi, belirli bir organizmanın eşleşme ortağının genotipine bağlıdır.