Yetişkin bir yeşil deniz kaplumbağasını tehlikeye atacak kadar büyük insan olmayan yırtıcı köpek balığıdır. Ancak, yavrular yengeçler, martılar, köpekbalıkları, balıklar ve memelilere karşı hassastır. Tehlike altında olmasına rağmen, yeşil deniz kaplumbağaları etleri, kabukları ve yumurtaları için onları öldüren insanlara karşı da hassastır.
Yeşil deniz kaplumbağaları yumurtadan yeni çıktıklarında daha savunmasızdır. Kuluçkahane olarak, kendilerini yönlendirmek için ayın ışığının su yüzeyindeki yansımasını kullanarak, plaj yüzeyine kazmak ve okyanusa yönelmek için birlikte çalışırlar. Bununla birlikte, yapay ışıklar onların kafalarının karışmasına ve yanlış yöne gitmelerine neden olarak, yumurtadan çıkma ölümlerine katkıda bulunur ve onları daha fazla avcıya maruz bırakır. Yüzlerce kuluçkahaneden sadece bir veya iki tanesi ilk yıllarında ortalama olarak hayatta kalır.
Yeşil deniz kaplumbağaları ayrıca kirlilik, insani gelişme ve nüfuslarını büyük oranda azaltan hastalıklara karşı da hassastır. Bazıları ticari balık ağlarında dolanıp boğulurken, diğerleri çöp veya deniz enkazı yiyip ölebilir. Her yıl, tekne pervanesi kazalarında kaplumbağalar da yaralanmaktadır. Kıyı gelişimi tanıdık yuva alanlarını ortadan kaldırarak dişi yeşil kaplumbağaları yumurtalarını bırakacak güvenli bir yer bırakmaz. Yeşil deniz kaplumbağaları, tümörlerin yumuşak dokularında büyümesine neden olan, bilinmeyen kökenli bir hastalık olan fibropapillomaya karşı da hassastır.
