Yarasalar genellikle sessizce algılanamayan ve uçuş sırasında onları yakalayabilen baykuşlar ve şahinler gibi diğer gece hayvanları tarafından avlanır. Yılanlar ayrıca meyve yiyen yarasaların iyi kamufle edilmiş bir başka yırtıcı hayvanıdır.
Yarasalar, erişilebilir olan yarasa evlerinde tünettikleri zaman yılanlara özellikle hassas olabilirler. Yılanlar, yarasa mağaralarının açılışında beklemek üzere yatma kabiliyetine sahip yetenekli dağcılardır. Gelincikler, rakunlar, vizon ve hatta bazı tarantulalar, yarasaları da lezzetli bir yemek olarak sunan fırsatçı avcılar.
Ancak, adam yarasalar için en büyük tehdittir. Tuzak kurmak, insanlara zarar vermek ve bunun sonucu olan yaşam alanını tahrip etmek çok zor oldu. Yarasaların uygun bir gıda kaynağı olduğu kabul edilen bazı ülkelerde, avcılık yarasa popülasyonları için ciddi bir tehdit oluşturmaktadır.