Her ne kadar Thomas Jefferson, güçlü bir federal hükümet fikrini başlangıçta desteklese de, özellikle savaş borçlarının finanse edilmesiyle ilgili olarak Federal İskender Hamilton görüşlerine karşı çıkan muhalefet nedeniyle 1793 yılında Başkan George Washington’un kabinesinden istifa etti. Jefferson’un Kentucky Kararı’nın anonim olarak hazırlanmasında devletlerin haklarının ilk yazılı beyanlarından biriydi ve 1793 Federalist destekli Alien ve Sedition Kanunlarının anayasaya aykırı olduğunu kanıtlama girişimi oldu. Jefferson, federal hükümetin Amerika Birleşik Devletleri Anayasasında açıkça yasaklanmayan her türlü yetkiyi kullanabileceğini ileri süren zımni güçler kavramını tamamen reddetti.
Thomas Jefferson, 1801’de ABD’nin üçüncü başkanı oldu ve eski Federalist atamaları hızla kendi Demokrat-Cumhuriyetçi Partisinin üyeleriyle değiştirdi. Başkan olarak, öncelikle dış ilişkilere odaklandı ve devletlerin yerel yönetim konularında kendi kararlarını vermelerine izin verdi. Jefferson, idaresinin başlangıcında, viski tüketim vergisini ve diğer federal vergileri iptal etti, gereksiz hükümet daireleri olduğunu hissettiğini kapattı ve Alexander Hamilton tarafından kurulan önceki Federalist mali sistemi ortadan kaldırmaya başladı.
Jefferson’ın amacı, ABD’nin Devrim Savaşında savaştığı İngiliz monarşisine benzerlik gösteren bir Amerikan aristokrasisinin kurulmasını engellemekti. Devletlerin haklarını ve yerel yönetime müdahale etmeyen bir federal hükümeti savunması, bazı devlet hükümetlerinin iç savaşa yol açan siyasi ihtilaflarda sendikadan ayrılma hakkı olarak yorumladığı bir doktrindi.
