1992'de Jill Rhodes'la buluştuktan sonra, Sean Hannity, papazı ve meslektaşlarının muhalefetine rağmen 1993 yılında evlendi. Çiftin 2015 itibariyle birlikte iki çocuğu var.
1992'de, Hannity, Alabama'nın Huntsville kentinde çalıştı ve burada kendi öğleden sonra radyo şovunu yaptı. Huntsville Times'ın yazarı olan Rhodes'la tanıştığı şehirde belediye başkanlığı tartışması yaptı. İkisi üç aylığına çıktı ve Hannity, Georgia, Atlanta'da bir talk-radio programı teklifini kabul ettiğinde, onunla birlikte taşınmasını istedi. Evlenmeleri şartıyla kabul etti.
Hannity, Hannity'nin papaza kilisenin çok liberal olduğunu söylediğinde çiftin papazı ile evlilik öncesi danışmanlık sırasında siyasi bir tartışmaya girdi ve papaz, Rodos'a Hannity ile evlenmeyi çıldırdığını söyledi. Gazetedeki meslektaşları, bir radyo sunucusu olarak çalışması nedeniyle onunla evlenmemesini de önerdi. Buna rağmen, çift, 9 Ocak 1993'te evlendi. Hannity, papazın, çiftin arkadaşlarının çoğunu da evlendirdiğini, ancak Hannity ve Rhodes'ın hala evli olan tek çift olduğunu belirtti.
Çiftin bir erkek ve bir kız çocuğu var. Oğulları Patrick, 2005 yılında doğdu. Kızları Merri Kelly, 2008 yılında doğdu.
