Andrew Weil, MD, aynı zamanda bir antibiyotik reçetesinin başladığı sırada probiyotik tedavisine başlamayı önerir. Probiyotikler kahvaltıda ve akşam yemeğinde yiyecekle birlikte alınabilir ve birkaç güne kadar kesilmemelidir antibiyotiklerin turu tamamlandıktan sonra. Weil, milyarlarca koloni oluşturan birimin yanı sıra Bacillus coagulans (BC-30) veya Lactobacillus GG suşlarını içeren markaların kullanılmasını önermektedir.
NowFoods, üreticinin tavsiye ettiği saklama talimatlarını takip ederek canlı bakteri kültürlerinin bütünlüğünün korunmasının önemini vurgulamaktadır. Sıvı probiyotikler, taze kalmaları için buzdolabında saklanmalıdır ve kapsüllerin ve tabletlerin aynı şekilde muamele görmeleri önerilir. Bu mümkün değilse, kapsüller ve tabletler sıcak ve nemden uzak, serin ve kuru bir yerde muhafaza edilmelidir. Probiyotikler genellikle zararlı çevresel etkilere maruz kalmalarını yönetmek için tazelik paketleri ile birlikte satılır. Bu takviyelerin gücü, birkaç ay boyunca, her ne kadar işe yaramaz hale gelene kadar, her ay yaklaşık yüzde 5 oranında yavaş yavaş azalır. Probiyotiklerin buzdolabında saklanması, bu düşüş hızını yavaşlatmaya yardımcı olur ve etkinliklerini uzatır. Bu nedenle Weil, insanlara probiyotiklerin son kullanma tarihinden haberdar olmalarını ve bu tarih geçerse onların yerini almalarını önerir.