2015 yılı itibariyle kanıtlar, probiyotiklerin, Clostridium difficile ile ilişkili bazı semptomların tedavisinde yardımcı olduğunu göstermektedir, ancak Ulusal Sağlık Enstitüleri'ne göre, tüm probiyotikler aynı etkileri sağlamamaktadır. Bilim adamları hangi spesifik probiyotiklerin faydalı olacağından emin değiller ve antibiyotikler genellikle etkili bir tedavi yöntemidir.
Ayrıca, şiddetli enfeksiyonu olan hastalar, kolon büyük ölçüde iltihaplandığı zaman ishal gösteremezler, Ulusal Sağlık Enstitüleri. Komplikasyonlar toksik megacolon ve şiddetli kemik veya kalp enfeksiyonları gibi sorunlara neden olabilir ve hayati tehlike oluşturabilir. Antibiyotiklerin kullanımı tipik olarak gereklidir ve bazı durumlarda bu durum ameliyat gibi daha yoğun bir tedavi gerektirir.
