"Pokémon Yellow" özel Pokémon, gizli teknikler ve gizli eşyalar dahil birçok sır saklar. "Pokémon Red" veya "Pokémon Blue" dan farklı olarak, üç başlangıç Pokémonunun tümünü edinmek mümkündür. Squirtle'ı almak için oyuncuların önce Teğmen Surge'yi geçmesi gerekir. Sonra, memur Jenny'yi şehrin ortasında bulmalılar; o güçlü su Pokémon'u sunuyor.
Charmander, Cerulean City'ye gidip kuzeye giden köprüdeki beş antrenörü yenerek bulunabilir. Eğitmenleri dövdükten sonra, oyuncular ilk kare yürüme yoluna gidebilir ve oradaki adamla konuşabilir; Bir Charmander'dan vazgeçti. Bulbasaur, Cerulean City'de de bulunur. Oyuncular yaralı Pokémon'u önemseyen Melanie ile tanışmak için Pokémon Center'ın yanındaki eve gidebilirler. Pikachu mutlu olursa, Melanie oyuncuya Bulbasaur'u sunar. Pikachu mutlu olmazsa, oyuncular Pikachu'ya art arda beş iksir verebilir ve ardından Melanie ile tekrar konuşabilir.
Efsanevi Zapdos'u bulmak için oyuncular Kaya Tüneli yakınında suya girmek için Surf tekniğini kullanmalıdır. Çıkışa yakın Zapdos'un yerini bulmak için Santral'e giden akışı takip etmeleri gerekir. Gizli Mimik tekniğini bulmak için, bir oyuncunun önce Celadon Mart'ta bir Pokédoll alması gerekir. Ardından, Saffron Şehrine gitmeli ve nadir tekniği paylaşan Copycat ile konuşmalı. Celadon City'de oyuncular bazı gizli paraları bulmak için Oyun Köşesine bakabilirler. Bu paraları yerde bulmak için etraflarında dolaşıp "A" ya tekrar tekrar basabilirler.
