Master Ball'ları klonlamanın en kolay yollarından biri, Pokémon Emerald oyun versiyonunda Battle Tower klonlama aksaklığını kullanmaktır. Üçüncü nesil Pokémon oyunlarından olan Pokémon Emerald'da klonlanan öğeler, Pokémon'un daha sonraki sürümlerinde de işlem görebilir.
Pokémon tarafından, Savaş Topu'ndaki Master Ball gibi klonlama sürecinde tutulan eşyalar klonlanır. Oyuncu, Elite Four'u yendiğinde Savaş Kulesi'ne girebilir.
Aşağıdaki, Pokémon Emerald’daki öğelerin nasıl klonlanacağını gösterir:
1. Adım
Savaş Kulesine girdikten sonra, en sağdaki bilgisayara gidin ve herhangi bir Pokémon yatırın.
2. Adım
Pokémon'u Master Ball'a tutun, bilgisayarı kapatın ve sonra oyunu kaydedin.
3. Adım
Bilgisayarı tekrar açın ve Pokémon'u Master Ball ile geri çekin. Kadına doğru yürüyün ve savaş için iki Pokémon'a girin.
4. Adım
Oyunu kaydetmenin uygun olup olmadığı sorulduğunda "Evet" i seçin. Kadın oyunu kaydetmeyi istediğinde, Game Boy Advance'i sıfırla.
5. Adım
Oyun sıfırlandıktan sonra Master Ball'lu Pokémon PC'ye ve oyuncunun oyun çantasına geri dönecektir.