Her biri kendi avantajına sahip olan Pixelmon mod paketine adanmış birçok "Minecraft" sunucusu vardır. Oynamak için, önce Pixelmon mod paketini Teknik Başlatıcı veya Forge mod yükleyici ile kurun ve ardından katılmak için bir sunucu seçin.
Pixelmon mod paketi, "Pokémon" oyunuyla bir melez oluşturmak için "Minecraft" oyununu değiştirir. Başlangıçta kullanıcılardan bir başlangıç Pokémon'u seçmeleri istenir ve daha sonra diğer Pokémon'larla savaşmak ve onları yakalamak için ücretsiz dizgin verilir. Poké Topları Kayısılar, demir külçeler ve taş düğmeler kullanılarak üretilir. Vahşi bir Pokémon veya diğer bir eğitmen ile savaşmak için bir Poké Ball atın ve istediğiniz rakibe çarpın. Bu, savaş menüsünü açar.
Bir Pixelmon sunucusuna katılırken, oynatma için yeni seçenekler ortaya çıkar. Ticaret, etkinlikler, yarışmalar ve grupların yaptığı gibi uygun hale gelir. Bazı sunucular düşme hasarı, açlık ve doğal "Minecraft" çetelerini kaldırarak oyunu daha da kişiselleştirir. Diğer sunucular çevreye daha fazla odaklanır ve PokéCenters ve spor salonları için ayrıntılı yapılar oluşturur. 12 Temmuz 2015 itibariyle, Pixelmonservers.com'daki en iyi üç Pixelmon sunucusu DestinyMC, RC-Pixelmon ve PPMC Pixelmon Ağı'dır.
Birçok yüksek hacimli Pixelmon sunucusu, oyuncu sıralamasındaki artış veya nadir oyun içi eşyalar gibi ücretli hizmetler sunar. Bu teklifler ve ücretler değişiklik gösterir.