Nijerya, 1 Ekim 1960’ta İngiliz hükümeti tarafından yasalaştırılan anayasalarla bağımsızlık kazandı. Yeni Anayasa, seçilmiş bir Başbakan ve bir tören personeli ile federal bir hükümet sistemi kurdu. p>
1959'da baş gösteren bağımsızlıkla, bir lider seçmek için bir seçim yapıldı; ancak hiçbir parti çoğunluk kazanmadı. Nijerya Ulusal Nüfus Komisyonu (NPC), vatandaşları için uygun bir hükümet oluşturmak üzere Nijerya Ulusal Konseyi ve Kamerun (NCNC) ile birleşti. NPC’nin başbakanı Abubakar Tafawa Balewa’yı, başbakan olarak NCNC’in Azikiwe’i genel vali olarak seçtiler. Nijerya 1963’te cumhuriyet yaptığında Azikiwe cumhurbaşkanı oldu.
Nijerya'nın bağımsızlığının ilk birkaç yılında Nijerya bölgeleri arasında büyük bir karmaşa ve çatışma yaşandı. 1962'de, batı bölgesinde, Güney Afrika Ulusal Demokrat Partisi'ni (NNDP) oluşturmak üzere S. I. Akintola'ya ayrılan bir diğer siyasi parti olan Eylem Grubu'nun bir parçası vardı. 1963 yılında, orta batı Edo bölgesi batı bölgesinin bir bölümünden kuruldu. 1964 seçimlerine ateşli bir şekilde itiraz edildi ve NPC-NNDP koalisyonu (Ulusal İttifak olarak adlandırıldı) muzaffer oldu. Hausa ordusu subaylarının yönettiği darbeler 1966, Ironsi'nin ölümünden sorumluydu. O yıl daha sonra kuzeyde yaşayan birçok Igbo katledildi.