Nijerya'nın güneydoğu illerinin ayrılmaya teşebbüs edilmesi Nijerya İç Savaşı'nın sebebiydi. Bu çatışmanın bir diğer adı da Biafran Savaşı.
İlin ayrılma nedenleri bir dizi siyasi, dini ve ekonomik faktöre dayanıyordu.
Seçim bölgeleri, uzun zamandır demokratik kurumları olan etnik bir grup olan Igbo tarafından dolduruldu. Bu, siyasi gelenekleri daha otokratik olan kuzey ve batı kültürleriyle güçlü bir şekilde tezat oluşturdu.
Güneydoğu illeri, ağırlıklı olarak Müslüman olan kuzey ve batı Nijerya’dakilerin aksine, büyük ölçüde Hristiyandı. Sonuncusu Igbo bağları olmayan memurlar tarafından yürütülen bir askeri darbe saldırısı, durumu daha da kötüleştirdi.
Son olarak, Biafran topraklarındaki petrolün varlığı, kaybedilmesi durumunda Nijerya'nın geri kalan tüm bölgelerine zarar verebilecek güçlü bir ulusal gelir kaynağıydı.
Etnik şiddet ülkeyi daha da istikrarsızlaştırdı. Geçici durumun kontrolünü ele geçirmek amacıyla General Odumegwu Ojukwu, Nijerya'dan bağımsızlığını ilan ederek 30 Mayıs 1967'de Biafra Cumhuriyeti'nin kurulmasını istedi. Nijerya İç Savaşı, 6 Temmuz 1967 ile 16 Ocak arasında gerçekleşti. 1970 ve savaş ve açlık yoluyla bir milyondan fazla asker ve sivilin hayatını iddia etti. Biafra nihayet Nijerya'ya geri gönderildi.