Müziğin beyindeki olumsuz etkileri, bilgileri konsantre etmek ve ezberlemek için azaltılmış bir yetenek içerir. İnsanlar, zevk almadıkları müzik dinlerken, ajitasyon veya başka olumsuz duygular da yaşayabilir.
Müzik beyinde derin bir etkiye sahiptir. Beynin iki yarım küresini birbirine bağlar ve motor korteks, duyusal korteks, işitsel korteks, hipokampus, serebellum, amigdala, nukleus accumbens ve prefrontal korteks gibi beynin birçok parçasını aktive eder. Bunun duygusal tepkiler, duyusal tepkiler ve beynin ödül merkezi üzerinde etkisi olabilir.
Bununla birlikte, bu beyin aktivitesinin tümü rahatsız edici olabilir. Fon müziği konsantrasyonu azaltabilir, bu da çalışırken veya çalışırken bilgiyi korumayı zorlaştırabilir. Ancak, çalışmadan önce müzik dinlemek yararlı olabilir, çünkü beynin konsantrasyonda yer alan önemli kısımlarını fon müziğinin rahatsız edici etkileri olmadan aktive edebilir.
Müzik, güçlü duygusal tepkileri ve beynin ödül merkezini harekete geçirebilse de, insanlar sevmedikleri müzik dinlerken olumsuz tepkiler alabilir. Bir Nöroloji Dergisi 2006 tarihli bir makaleye göre, bazı müzik türlerini dinlemek, bazı tıbbi hastalarda gerginlik gibi ajitasyon belirtileri üretebilir. Bazı müzikler, bazı kişilerde, özellikle söz konusu müzik güçlü anılar uyandırdığında çok büyük duygusal tepkilere neden olabilir.