Kalamarın mürekkep kesesinin işlevi, yırtıcılardan korunmasını sağlamaktır. Mürekkep kesesi, kalamarın çok fazla tehditten kaçmasına izin veren mürekkep patlamalarını önler.
Kalamardan gelen mürekkep, bir avcıyı geçici olarak rahatsız eden ve körleyen bir su altı bulutu oluşturur. Bu mürekkep toksik değildir. Kalamar üzerindeki mürekkep kesesi kastan yaratılmıştır ve hayvanın arka bağırsağında bulunur. Kalamarın içindeki mürekkep melaninden yapılmıştır.
Kalamar mürekkebi az miktarda kullanır, çünkü yavaş bir metabolik hızda çoğalır. Bu nedenle, yalnızca kalamar kışkırtıyor veya tehdit altında hissediyorsa kullanılır.