Mineraller, organik süreçler, kristalleşme, erime ve mineralin katı halde meydana gelen kristallografik dönüşümlerden oluşur. Kristallografik dönüşümler, genellikle mineral birikintisini çevreleyen malzemedeki basınç veya sıcaklıktaki bir değişiklikle oluşur. .
Mineraller bazen kalsiyum gibi moleküler bileşenlerinin canlılar tarafından alınmasından dolayı oluşur. Buna bir örnek, kalsiyum karbonatın iskeletlerine katıldığı kokkolitoforlar olabilir. Mineraller bazen kristalleri oluşturmak için sıvı içinde bir araya toplanarak oluşur. Soğutucu bir magmatik kayanın içinde yeni mineraller de sentezlenebilir. Yerkabuğunda bulunan çoğu mineral bu şekilde oluşmuştur.
