Pixelmon, "Minecraft" ta fan tarafından oluşturulan bir değişikliktir. Bu mod, ağırlıklı olarak Pokemon oyunlarına dayanmaktadır ve oyuncuların savaş için çeşitli Pokemon'ları bulmasını, yakalamasını ve eğitmesini sağlamak için tasarlanmıştır.
Pixelmon, oyuncuya Charmander, Bulbasaur, Squirtle, Totodile, Cyndaquil, Chikorita, Treecko, Mudkip ve Torchic gibi başlangıç Pokemon listesinden seçim yapmasını sağlayarak başlar. Oyuncu bir başlangıç Pokemonu seçtiğinde, oyunu oynamaya başlayabilir.
Oyun başladıktan sonra, oyuncular Pokemon'ları ile yakalayabilir, ticaret yapabilir, eğitebilir ve savaş yapabilir. Bir Pokemon daha fazla savaşırken tecrübe kazanır ve Pokemon yeterli tecrübe edindiğinde, kendisinin daha büyük ve daha güçlü bir versiyonuna dönüşür.
Oyun dünyasına dağılmış, kendi Pokemon'larına sahip diğer bilgisayar kontrollü karakterler. Bir oyuncu bu karakterlerle temas ederse, savaş başlar. Oyuncunun, bitene kadar savaşta kalması gerekir; bu, bir takımdaki tüm Pokemonların bayılmadığı zamandır.
Oyuncular ayrıca, diğer antrenörlerin sahip olmadığı Pokemon'u yakalamak için kullanılan öğeler olan kendi Pokeballlarını oluşturma görevini de üstlenirler. Buna ek olarak, Pixelmon, oyuncuların spor salonu savaşları gibi etkinliklerde yer aldığı çeşitli sunucularda oynanabilir.
