Mikrobiyolojide alt kültürlenmenin amacı, deney ve testler için uygun bir mikrop numunesi yetiştirmek ve sürdürmektir. Alt kültür oluşturma, hücrelerin veya mikroorganizmaların ömrünü uzatır, böylece uzun süreli bakım ve kültürün izlenmesine izin verir.
Alt kültürleme işlemi, mikropların bir büyüme kabından diğerine aktarılmasını ve mikroplara katı veya sıvı bir ortamda taze bir besin kaynağı sağlamayı içerir. Alt kültür oluşturma, analistin türlerin tanımlanmasında kullanılan bilgileri elde etmek için sıcaklık ve fiziksel ortam gibi bir mikropun habitatının parametrelerini değiştirmesini sağlar. Bir mikrobiyal kültürün nerede yaşadığını veya öldüğünü anlamak, onun zorlanmasını izole etmeye yardımcı olur. Bazı durumlarda, yeni kültürün alt kültür transferinden sonra ortaya çıkması için gereken sürenin uzunluğuna bağlı olarak bir mikrobiyal kültür tanımlanabilir.
Deniz yosunundan elde edilen jelatinli bir madde olan agarlı Petri kapları mikroorganizmaları büyütmek için katı bir ortam olarak kullanılır. Sıvı bir ortama ihtiyaç duyulduğunda yapay bir besin suyu kullanılır. Et suyunda yetişen karışık mikroorganizma içeren kültürlerin, doğru tanımlama için kolonileri izole etmek üzere katı bir ortam üzerine alt kültürlenmesi gerekir. Agar yüzeyinde bir kez, her mikrop kolonisi, tek bir hücrenin çoğalmasından kaynaklanan tek bir mikroorganizma türünü temsil eder. Bu tanımlanmış ve izole edilmiş koloni saf bir kültür denir ve mikrobiyolojik araştırmalarda önemli bir başlangıç noktasıdır.
