Mesozoyik çağda yaşayan bitkiler arasında sikadlar, sikadeoidler, ginkgoitler, ginkofitler, kozalaklı ağaçlar, glossopteridler ve anjiyospermler bulunur. Çağın sonunda, anjiyopermler görünmeye başladı.
Mesozoyik dönemi, birçok farklı bitki türünün yükselişini gören üç döneme ayrılmıştır. İlk iki dönem, Triyas ve Jura dönemleri, çam ağaçları gibi, çiçeklerinde tohum bulunmayan bitkiler olan gymnospermlerin yükselişini gördü. Triyas döneminde, dünya bitki örtüsünün yüzde 20'si cycad'lardı. Şu anda dünyada yalnızca birkaç sikad türü kalmıştır. Parlaklıkta kalanlar, bu dönemde, Jurassic döneminden önce soyları tükenmiş olmasına rağmen, büyümüşlerdir.
Jura döneminde, günümüz eğrelti otlarının birçok özelliğine sahip olan sikaslar hala gelişmiştir. Skadeoitler, Jura döneminde de gelişti ve bu bitkiler çok sikad gibiydi ancak bazı üreme farklılıkları vardı. Mesozoyikten hemen önce başlayan Ginkgophytes, 11 farklı türe yayılmaya başladı. Kozalaklılar da büyümeye ve yayılmaya başladı.
Mesozoyik dönemin son dönemi, Kretase dönemi, anjiyospermlerin veya çiçekli bitkilerin yükselişini gördü. Bugün, dünyadaki bitki yaşamının çoğu anjiyospermler olarak sınıflandırılmaktadır.