Mesih Kilisesi'nin öğretisi, birinci yüzyıldan kalma A.D. İsa'nın Yeni Ahit öğretileridir ve Mormon Kitabı'ndan 19. yüzyıl öğretilerini içerir. Cemaatler, inançlarını tanımlamak ve 1850'lerin sonlarında Mesih Kilisesi'nin doktrinini oluşturmak için işbirliği yaptılar.
İncil ve Mormon Kitabı'nın öğretilerinin farklı yorumları iki ayrı kilise yaratan bir şizme yol açtı. Kırsal İllinois'teki dört cemaat, 1853 yılında Mesih Kilisesi'nin öğretisine sadık kalmaya söz veren bir konferans oluştururken, diğer konferans, Son Gün Azizleri İsa Mesih Kilisesi'ni oluşturdu. Çağdaş Mesih Kilisesi doktrini hala kilisenin İnanç ve Uygulama Makalelerinde İncil'den ve Mormon Kitabından gelen öğretilere atıfta bulunuyor.