Bireysel düzeyde, melez hayvanların bazen genetiklerinden dolayı üreme, sağlık veya davranış sorunları olabilir. Ekolojik olarak melezler tür çizgilerini bulanıklaştırır ve koruma için sorun yaratır.
Bir melez, iki ayrı tür veya alt türden ebeveynlerin yavrularıdır. Birçok tür, genetik veya davranışsal farklılıklar nedeniyle, uygulanabilir yavrular üretmek için iç içe geçemez veya birleşemez. Bununla birlikte, bazı durumlarda iki tür melez yavrular oluşturmak için genetik olarak yeterince benzerdir. Katırlar gibi bazı melezler sterildir. Katırlar, kadın bir at ile bir erkek eşek arasındaki bir çarpışmadan kaynaklanır. Katır sağlıklı yetişkinliğe erişebilse de, genellikle kendi başına gamet üretemez ve üremez.
Bir liger, bir dişi kaplan ve bir erkek aslan arasındaki bir melezdir ve genellikle her iki ebeveyne göre daha büyüktür. Ligerler sağlık problemlerine ve doğum kusurlarına yatkındır ve birçoğu erişkinlikte yaşayamaz. Kaplanın melez yavrularını doğurması da zor; büyük bedenleri anne için bir C-bölümü gerektirebilir.
Hibrit hayvanlar da öngörülemeyen davranış sergileyebilir. Ünlü bir örnek, yerli köpek ile kurt arasındaki çapraz olan kurt melezidir. Kurt melezi davranışı konusuna ilişkin birkaç hakemli makale yazılmıştır ve hayvanlar çok fazla tartışmaya girmiştir. Bazı mülk sahipleri melezlerinin yumuşak, utangaç hayvanlar olduğunu iddia ederken, diğer fıkralar kurt melezlerinin tahmin edilemez ve tehlikeli derecede agresif olduklarını gösteriyor. Sorunların bir kısmı, köpeklerin 15.000 ila 30.000 yıl boyunca evcilleştirilmesinden ve bu süre zarfında, sahiplerine yararlı olan belirli davranış kalıpları için seçici bir şekilde yetiştirilmesinden kaynaklanmaktadır. Bir kurt-köpeği haçının çelişkili genetiği tahmin edilemezliğe yol açar. Wolf melezlerinin de sahiplerini paket olarak görmesi muhtemeldir ve kendini dominant paket üyesi olarak göstermesi için sahibine özen gösterilmelidir.
Daha büyük ölçekli bir hibridizasyon problemi yabani hibritlerden gelir. Örneğin, bazı yabani su kuşları türleri, yerli meslektaşlarıyla kolayca karışabilir. Bu, bazı durumlarda bir türün hibridizasyon yoluyla nesli tükenme tehlikesi altında olduğu durumlarda, bir türün genetik sularını çamurlayabilir. Bu sorun hiçbir şekilde su kuşları ile sınırlı değildir. İskoç yaban kedisi, yerli kedilerle hibridizasyon nedeniyle nesli tükenme tehlikesiyle karşı karşıya.
