66 günlük yolculuk güçlü Atlantik fırtınaları ve yolcular arasındaki çatışmalarla doluyken Mayflower'daki yaşam tatsız ve zordu. dinlerini gemiye sürtünmeye yol açan başkalarına da zorla. Deniz tutması, aşağılık deniz ve diğer deniz hastalıkları yaygındı.
Mayflower’ın seyahatinin ikinci yarısındaki kaba Atlantik denizleri mürettebat ve yolcular üzerinde özel bir etki yarattı. Güverteye çıkanlar sert hava koşullarında denize atılma riskiyle karşı karşıya kaldıklarından, yolcuların çoğu seyahatlerin çoğu için güvertelerin altında kaldı. Aileler dar bölgelerde gizlilik bölücüler kurarken, alçak tavanlar ve karanlık, nemli koşullar yaşam koşullarını çok rahatsız etti.
Protestan hacılar, Mayflower'da, 102 yolcunun sadece 41'ini oluşturan bir azınlıktı. Yolculuğun başlarında, hacılar direnişlerinden dolayı şüpheyle gördükleri gemi arkadaşlarına dini inançlarını empoze etmeye çalıştılar. Sonunda, iki grup işbirliğinin yeni dünyada yolculuk ve refah içinde hayatta kalabilmelerinin tek yolu olduğunu fark etti ve bir sivil örgüt oluşturmak için Mayflower Kompaktını imzaladılar. Anlaşma modern demokratik yönetimin öncüllerinden biri haline geldi ve Amerika'da daha sonraki hükümetler için bir şablon olarak kullanıldı.