Kyoto Protokolü, iklim değişikliği kaçınılmaz bir sorun haline gelmeden önce ülkeleri karbon salımlarını azaltmaya teşvik etmek için bir çerçeve sunar, ancak bir kaç boşluk içerir ve ekonomik etkiler önemli olabilir. Birkaç imza sahibi onaylanmasından bu yana protokolü terk ederken diğerleri katılmayı reddetti.
Kyoto Protokolü ile ilgili yaygın bir şikayet, onun düzensiz uygulanmasıdır. Gelişmiş ülkeler kılavuz ilkeleri hedeflerken, gelişmekte olan ülkeler kısıtlamalarından muafiyet aldı. Bu, çeşitli ülkelerin göreceli refah ve ekonomik kapasitelerinin önemli bir kabulü olmasına rağmen, Çin ve Hindistan gibi gelişmekte olan ülkelerin bir dizi önemli sera gazı kısıtlamasını atlamasına izin vermiştir. Bu ülkeler sanayileşmekte ve bu süreçte daha fazla kirlilik ürettiğinden, bu potansiyel olarak tehlikeli bir boşluk olarak görülebilir.
Ekonomik etkiler, Kyoto Protokolü ile sıkça belirtilen bir başka problemdir. Fosil yakıtlar genellikle yenilenebilir kaynaklardan daha ucuz olduğundan, emisyonların azaltılması ya daha pahalı güç kaynaklarına geçiş yapmak ya da emisyon kontrol teknolojilerine büyük miktarda para harcamak anlamına gelir. Ayrıca, anlaşmayı onaylayan, ancak emisyonlarda beklenen düşüşü sağlayamayan ülkeler finansal cezalarla karşı karşıya kaldı.
Bununla birlikte, tüm sorunlarıyla birlikte, Kyoto Protokolü büyük ve dünya çapında bir soruna yöneliktir ve iklim değişikliği ve sera gazı emisyonları potansiyel tehdidi konusunda farkındalığı arttırmıştır.
