Keşif’e göre, Kleopatra’nın dört çocuğu vardı. Biri Julius Caesar’ın babası. Diğer üç, iki oğlan ve bir kız, Mark Antony ile beraberdi.
Kleopatra'nın ilk oğlu babasının ardından Caesarion seçildi. Octavianus'un emri altında öldürüldü, ancak Kleopatra ve Marc Antonius'un çocukları bağışlandı. Bu çocukların büyük ikisi ikiz, Alexander Helios adında bir çocuk ve Kleopatra Selene adında bir kız çocuğuydu. Kahire'deki Mısır Müzesi'nde, bu ikizleri temsil ettiğine inanılan bir heykel var. Son çocukları Ptolemy Philadelphus adında bir oğuldu. Ebeveynlerinin ölümünden sonra, üç çocuk, Mark Antony'nin karısı Octavia tarafından büyütüldüğü Roma'ya gitti.