Karşı-Reformasyon hareketi, Martin Luther'in Roma Katolik Kilisesi'ne güçlü bir muhalefet etmesi ve Almanya Prenslerinin meydan okuması sonucunda başladı. Hareketin başlamasından önce Katolik Kilisesi Bir zamanlar Katolik bir keşiş olan Martin Luther'in öncülüğünde keskin eleştirilere maruz kalmıştı.
Karşı-Reform hareketi, kilisenin karşı karşıya kaldığı hoşnutsuzluğu ve muhalefeti yönetmek için Katolik Kilisesi tarafından başlatıldı. Kendini dini meselelerde bir otorite olarak kanıtlamış olan Martin Luther, birçoğunu Katolik Kilisesi'ni İncil'in yollarını öğretmeyen fakat kendi rotasını ilerleten biri olarak görmeye ikna etmeyi başardı.
Bu, Katolik Kilisesi'nin kendisinde reform vaadi bulunan birçok insanı çeken hareketin oluşumuyla karşılandı. Trent Konseyi tarafından, işkenceyi de içeren ağır cezaların kiliseye karşı çıkmaya cesaret edenlere karşılanacağı çeşitli kararnameler belirlenmiştir. Soruşturmalar, işkence ve kilise kurallarının uygulanması, Roma Engizisyonu adlı bir itaat ajansı tarafından gerçekleştirildi.
Katolik Kilisesi tarafından kınan 583 metin içeren Yasak Kitaplar Dizini yayınlandı. İncil tercümeleri ve bazı Luther, Calvin ve Erasmus eserlerini içeren metinler sapkınlık olarak markalandı.
