John Hagee, 1975 yılında bir mektupta ahlaksızlıktan suçlu olduğunu cemaatine yazdı, ardından karısı Martha Downing'den boşandı. Tam ahlaksızlık bilinmemektedir. 12 Nisan 1976'da cemaatinin üyesi olan Diana Castro ile evlendi. Boşandıktan hemen sonra yapılan yeniden evlenme, evliliği sırasında bir ilişkisi olduğunu iddia etti.
Hagee, 1960 yılında Downing ile evlendi ve çiftin birlikte iki çocuğu oldu. Hagee, San Antonio'daki Trinity Kilisesi'ndeki papazdı, ancak boşanmasından gelen eleştiri istifa etmesine neden oldu.
Hagee, Castro, Matthew, Christina ve Sandy adında üç çocuğu vardır. Hagee ve Castro'lu çocukları da, Hage'leri birlikte yapan müzisyenlerdir.
11 Mayıs 1975'te Hagee, Castle Hills'teki The Church adlı yeni bir kiliseye başladı. Başlamak için sadece 25 üyesi olmasına rağmen, hızla büyüyerek iki genişlemeye yol açtı. Birincisi 1.600 sandalyeli bir sığınak ve ikincisi 5.000 sandalyeli bir sığınaktı. Hagee, ikinci tapınağın temel taşı oldu. Oğlu Matthew, daha sonra kilisenin baş papazı olarak devraldı.
Hagee kitaplar yazdı ve çok sayıda dini televizyon kanalı vaazlarını yayınladı. Ayrıca dini örgütler kurdu.