Kare bayraklı iki ülke İsviçre ve Vatikan'dır. Bununla birlikte, İsviçre bayrağı Olimpiyat oyunlarında diğer ülke bayraklarına uyan 2: 3 dikdörtgen oranıyla görülebilir.
İsviçre bayrağı, beyaz haç ile kare ve kırmızı renktedir. Denizde, ancak, İsviçre Deniz Ensign kullanılır; 1: 1 kare oranlar yerine 2: 3 dikdörtgen oranlara sahiptir. Bayrak hem New York hem de Cenevre'deki ABD merkezinin dışına çıkarıldığında standart kare oranlarında tutulur.
Vatikan bayrağı, solda sarı, sağda beyaz dikey olarak bölünmüştür. Beyaz sağ tarafta, papalık tacı olan iki çapraz anahtarı olan bir amblem var. Amblem, İncil'in Yeni Ahit'inde belirtilen anahtarlara atıfta bulunur ve sembolize eder: St. Peter'ın cennet krallığına erişimi veya zamansal ve manevi meseleler üzerindeki papaliliğin egemenliği. Vatikan bayrağı eskiden kırmızı ve altındı ancak 19. yüzyılın başlarında sarı ve beyaz çizgilerle değiştirildi. Aynı zamanda Saint Peter ve Saint Paul temsillerine sahipti.