Penguenler, foklar, katil balinalar ve köpekbalıkları da dahil olmak üzere çeşitli avcı hayvanlarına sahiptir. Popüler inanışın aksine, kutup ayıları penguenlerin avcıları değildir; kutup ayıları kuzey yarımkürede, penguenler ise güney yarımkürede yaşar.
Tür ne olursa olsun, penguen yumurtaları ve civcivlerin yetişkinlerden daha fazla yırtıcı hayvanı vardır. Yumurtalar, kuşlar ve sıçanlar dahil olmak üzere çeşitli yırtıcı hayvanlar tarafından yenir. Birçok kuş, civcivler, özellikle de skuas, daha az grison ve dev türler gibi beslenir. Magellenik penguen yavruları büyük tüylü armadillolar tarafından bile avlanır. Bazı kuluçkahaneler yılanlara, yengeçlere ve diğer küçük avcılara avlanır. Büyük beyaz köpekbalıkları ve katil balinalar yetişkin penguenlerinin avcılarıdır. Leopar fokları en büyük penguen türlerini bile tüketirken, kürk ve Weddell fokları biraz daha küçük türlere konsantre olur. Deniz aslanları aynı zamanda penguenlerin önemli avcılarıdır.
Penguenlerin kendilerini yırtıcılardan korumak için birincil yolu sosyal alışkanlıkları, yüzme yetenekleri ve karşı gölgeli renk düzenidir. Karşı gölgeli hayvanlar dorsal olarak karanlık ve ventral olarak aydınlıktır. Koyu renkler yukarıdan bakıldığında okyanusla kamufle edilirken, açık renkler aşağıdan bakıldığında su yüzeyi ile kamufle olur.
Penguenler öncelikle krill, kalamar ve küçük balık türleriyle beslenir.
