Eylül ayında Cancun günlük ortalama 89 ila 90 derece Fahrenheit sıcaklığa ve günlük ortalama 76 ila 77 derece Fahrenheit sıcaklığa sahiptir. Havalar yaz aylarından biraz daha soğuktur ve kış aylarından belirgin şekilde daha sıcaktır. Eylül, Cancun’da yılın en yağışlı ayı olma eğilimindedir.
Cancun, eylül ayında ortalama 23 santimetre yağış alıyor. Eylül, Mayıs-Ekim ayları arasında gerçekleşen Cancun'un yağışlı mevsiminin ortasındadır.
Cancun'un en yüksek deniz sıcaklıkları Temmuz ve Ekim ayları arasında gerçekleşir. Bu ayların her birinde, ortalama deniz sıcaklığı 84 derece Fahrenheit, yüzme için rahat bir sıcaklık.
Eylül ayrıca Cancun’un kasırga mevsiminin bir parçasıdır. Daha sık yağışlara ek olarak, yılın bu zamanında tehlikeli fırtınalar oluşabilir. Cancun'taki insanlar içeride kalmaya ve fırtına tahmininde bulunursa güvenli bir sığınak yeri bulmaya hazırlıklı olmalılar.
Cancun’un Eylül ayındaki hava durumu yılın diğer zamanlarındaki hava koşullarından daha az istendiğinden, oteller daha az kalabalık ve daha ucuz olabilir. Güneşli günler olduğu için yılın bu zamanında plajın tadını çıkarmak hala mümkün. Cancun'un yağışlı bir mevsimi olmasına rağmen, her yıl ortalama 240 güneşli gün.