Erkek İguanalar, alnlarına çene kemiği ve iki yağ birikintisine benzeyen büyük çene kaslarına sahiptir, bu da erkek iguanaların kafalarını dişilerin kafalarından daha büyük ve blokajlıdır. Bir erkeğin ayrıca daha büyük, daha ağır bir gövdesi ve üreme organlarının bulunduğu kuyruğunun tabanına yakın bir çıkıntı vardır.
Erkek iguanaların iç uyluklarında da göze çarpan femoral gözenekler vardır. Bir iguananın kadın mı yoksa erkek mi olduğunu belirlemek için yeterince olgunlaşması 18 ila 24 ay sürer. İguana buruntan havalandırmaya kadar 6 ila 10 inç uzunluğa ulaştığında, ikincil cinsel özellikler ortaya çıkar.
