Epistemoloji ile ontoloji arasındaki fark, kısmen incelenen konudur. Ontolojide, varlık ya da varlık çalışması ve ne tür varlıkların var olduğu üzerine sorular incelenir. Epistemolojide, bilme ve nasıl tanıdığımız ve hangi bilginin ne olduğu ve bilginin nasıl mümkün olduğu ile ilgili sorular araştırılır.
Hem ontoloji hem de epistemoloji, felsefenin dallarıdır. Ontoloji, bir tür metafiziktir. Epistemoloji, genellikle, eski iddia bilgisinin ancak tecrübe ile kazanılabildiğine inanılırken, ikincisi bilginin yalnızca akıl yoluyla edinilebileceğine inandığı, ampirizm ve rasyonalizm arasındaki bir tartışmayı içerir.
Ontoloji, doğru olanla ilgilidir ve diğer yandan epistemoloji, bu gerçeği anlamanın farklı yöntemlerini içerir. Başka bir deyişle, ontoloji gerçekliğin doğası hakkındadır ve epistemoloji, araştırmacı veya diğer kişi ile o gerçek arasındaki ilişkidir.
Pek çok meselede çok sayıda, çoğu zaman çelişkili ontolojiler veya neyin doğru olduğuna dair teoriler, ayrıca çeşitli epistemolojiler veya bazı şeyleri çözme yöntemleri vardır. Örneğin, bilim ve din, Tanrı'nın varlığı ve evrenin kökenleri hakkında karşıt ontolojilere ve epistemolojilere sahiptir.
