Yeni türler sürekli keşfedildiğinden, dünyada kalan lemurların tam sayısını belirlemek zor olabilir. Bununla birlikte, çoğu türün nesli tükenmekte olan ve eleştirel olarak nesli tükenmekte olan olduğu düşünülmektedir ve bir türün neslinin tükenmesi yakındır.
2012 yılında Uluslararası Doğa Türlerinin Korunması Birliği Birliği tarafından yapılan bir incelemeye göre, Lemurlar dünyadaki en nesli tükenmekte olan memeli türleri arasındadır. Vahşi doğada 18 kişi kalıyor. Dünyada bilinen 103 tür lemurdan 93'ü tehdit seviyesindedir. Bu tehdit altındaki 93 türün 19'u "Savunmasız", 52'si "Tehlike Altında" ve 23'ü "Kritik Tehlike Altında" olarak sınıflandırılmıştır; Sadece üç türün nesli tükenmekte olduğu kabul edilmemektedir.
2005 yılında, 41 lemur türü "Hassas", "Tehlike Altında" veya "Kritik Olarak Tehlike Altında" kabul edildi. 2012 sayısındaki keskin artış iki önemli faktörden kaynaklanıyor: artan tehdit seviyeleri ve birkaç yeni lemur türünün keşfi.
Lemurlara yönelik en büyük tehdit habitat imhasıdır. Yaşam alanları Madagaskar adası ile sınırlıdır. Yaşadıkları yağmur ormanları, yasadışı kütük kaydı, yasadışı madencilik ve politik sorunlar nedeniyle tehdit altındadır. Lemurlar ayrıca kaçak avcıların tehditleriyle de karşı karşıya kalmaktadır.
Pek çok tür büyük tehditlerle karşı karşıya kalsa da, bazı türlerde iyileşme yaşanmıştır. Örneğin, daha büyük bambu lemur popülasyonu 100 kişiden 500 kişiye yükselmiştir.