Dinoflagellatlar, organizmanın vücudundan projekte olan iki farklı flagella'nın koordineli atışı tarafından desteklenen ileri sarmal hareketinde hareket eder. hücre.
Bir dinoflagellatın ortasına dolanan flagelluma enine flagellum denir ve protistin cingulum adı verilen yüzeyi boyunca bir oyuğa oturur. Enlemesine flagellum düzleştirilmiş bir görünüme sahiptir ve sadece dış kenarlar atmaktadır. Dalga hareketi, flagellum tabanından ucuna doğru ilerler. Enine flagellumun hareketi dinoflagellumu ileri doğru iter ve ayrıca dönüşü kolaylaştırır.
Arka flagellum veya uzunlamasına flagellum, hücre zarında başlar, organizmanın arkasına doğru bir yiv aşağı uzanır ve dinoflagellatın gövdesinin arkasına uzanır. Bu flagellum organizmayı ileri itmek için yavaş ve düzenli bir şekilde atıyor.
Flagella'nın bir dinoflagellat üzerindeki atma hareketi, her flagellum içindeki mikrotübül yapı ile mümkün olmaktadır. Mikro tüpler, tüpün merkezinde yer alan iki singlet ile dokuz çiftlik bir tüpte düzenlenir. Dış mikrotübül ikilileri birbirine yaslandığında hareket başlatılır ve bu hareket ATP ile güçlendirilir.