Deniz aslanları, öncelikle katil balinalar ve köpekbalıkları tarafından tehdit altındadır ve az sayıda doğal savunma mekanizmasıyla, sudan ve karadan mümkün olduğunca çabuk çıkarak bu avcılardan kaçmaya çalışırlar. her ikisi de doğal avcılarından daha hızlı yüzücülerdir ve eğer sağlıklı, tamamen büyümüş ve tehdidin farkındalarsa, kolaylıkla kaçabilirler.
Deniz aslanları için katil balinalardan ve köpekbalıklarından çok daha tehlikeli insanlardır. İnsanlar yiyecek, balina yağı, yağ ve kürk için deniz aslanları avlarlar. Hayvanlar, sadece avlarını korumak istemeyen ama balık ağlarını deniz aslanlarının yol açtığı zararlardan korumak isteyen balıkçılar ile rekabet etmelerini önlemek için öldürülür. 1800'lerin sonlarında, hükümetler halkın bir nüfus kontrolü yöntemi olarak lütuf için deniz aslanlarını öldürmelerine izin verdi.
Deniz aslanları insanlara karşı hiçbir savunmaya sahip değildir ve nüfusları ancak çeşitli hükümetlerle çalışan koruma gruplarının onları koruyan yasaları geçirme çabaları nedeniyle artmaktadır. Ancak bu yasalar dünya çapında değildir. Koruma statüsü bakımından, deniz aslanlarının savunmasız olduğu, kurtarma planlarının hazırlanıp uygulamaya hazır olduğu belirtilmektedir. 2014 yılı itibariyle ticari balıkçılık işlemleriyle etkileşimler, moloz ve ağlardaki dolaşma, petrol sızıntıları ve insan rahatsızlıkları deniz aslanı popülasyonlarına zarar vermeye devam ediyor.
