Abraham Lincoln tarafından öngörülen ve Andrew Johnson tarafından yürütülen Cumhurbaşkanlığı Yeniden Yapılanma, Kongre'nin Yeniden Yapılandırılmasının haklı ve sosyal açıdan dönüştürücü önlemlerinden çok daha yumuşak ve bağışlayıcıydı. Savaştan sonraki savaşa karşı daha yumuşak bir yaklaşım Politika sürekli onu Kongre'ye radikal cumhuriyetçilerle karşı karşıya getirdi.
Notre Dame Üniversitesi, Cumhurbaşkanı Rekonstrüksiyonu'nu, ulusal birliği ve Güney'in yaşayabilirliğini hızlı bir şekilde restore etme niyeti olduğunu açıkladı. Cumhurbaşkanlığı Yeniden Yapılandırmasının önemli unsurları, tüm mülklerin ABD'ye bağlılık ilan eden eski konfederasyonlara restorasyonunu ve yeomanlığa daha fazla ekonomik fırsat verilmesi gerektiğini içeriyordu. Johnson ayrıca, sıkıntılı eski kölelere yardım eden bir federal ajans olan Freedmen's Bureau’nun yenilenmesi için tasarısını veto etti.
Johnson’ın Başkanlık Yeniden İnşası’nın altında, serbest bırakılanlar haklarından mahrum kaldı, federal ordudan karalar çekildi, eski Müttefik liderliğinde oluşturulan milisler ve Güney’de yüksek derecede ayrımcı Kara Kodları çıkarıldı.
Johnson’ın politikalarının yetersizliğine cevaben, Kongre, kendi İmar mevzuatını yürürlüğe koydu. Kongre Yeniden İnşası, Güney'i cezalandırmak ve siyahlara yararlı bir toplumsal devrim yaratmayı amaçlıyordu. 1865'te Kongre cumhuriyetçileri Güneyli temsilcileri tanımadılar. Her iki Kongre evi de Güney eyaletlerinin temsil edilmeyi hak edip etmediğini belirlemek için ortak bir komite oluşturdu. Kongre aynı zamanda Başkan Johnson'ın Freedman Bürosu'ndaki vetolarına ve siyahlara vatandaşlık hakkı veren bir kanun olan Medeni Haklar Yasası'nı geçersiz kıldı.
