Bir ökaryotun hücre çekirdeği, bir nükleolus, kromatin, ribozomlar, nükleoplazma ve gözenekler içerir. Bu gözenekler, mesajcı RNA ve membran boyunca hareket eden protein gibi malzemelerin akışını düzenlemek için mevcuttur.
Nükleer zarf ayrıca içinde bulunan çekirdeği de tutar, böylece sitoplazma girmez. Nükleer zarf, çekirdeği dolduran sıvı olan nükleoplazmayı içerir. Kromatin, protein ve DNA'dan oluşur; nükleol, ribozom ve RNA üreten çekirdeğin merkezi yapısıdır.
Bitkiler ve hayvanlar ökaryotik hücrelere sahiptir. Bu hücrelerde, çekirdekler hacimlerinin yaklaşık yüzde 10'unu oluşturur.
