Büyük Bariyer Resifi, birçok nedenden ötürü önemlidir. Kıyı şeridini tropikal fırtınaların ve dalgaların zararlı etkilerinden korur, karbon ve azot sabitlemesine yardımcı olur, besinlerin geri dönüşümüne yardımcı olur ve yaşam alanı sağlar. Queensland Müzesi'ne göre çeşitli deniz organizmaları.
Büyük Bariyer Resifi ve mercan resifleri, birim alan başına diğer deniz ortamlarından daha fazla türü destekler. Bu biyoçeşitlilik, hastalıklar için yeni ilaçlar ve tedaviler keşfetmek için çok önemlidir. Mercan resifleri de ekonomik başarı için önemlidir. Mercan kayalığı turizmi, resif ile ilgili dinlenme etkinlikleri ve restoranlar ve turistler için konaklama olanakları sayesinde yerel ekonomileri güçlendirir. Mercan resifleri, Ulusal Okyanus ve Atmosfer İdaresi tarafından bildirildiği gibi, ABD balıkçılık için önemli bir kaynaktır.
Mercan resifleri, insan girişimi nedeniyle bozuluyor. Tekneler ve eğlence amaçlı temas resiflerde fiziksel hasara neden olur. Su birikintisindeki tortu, kirletici madde, tarım, sanayi, lağım ve toprağın temizlenmesi, mercan resiflerinin sağlığını tehdit ediyor. ABD Çevre Koruma Ajansı'na göre, kötü su kalitesi, artan su sıcaklıkları ve artan kirlilik, son üç yılda görülen biyolojik çeşitliliğin yaygın ölümünden sorumlu olan mercan hastalığı için daha yüksek bir olasılık yaratıyor.