Boksör köpekler, kalp sorunları, omurilik bozuklukları, şişkinlik, alerjiler ve çeşitli kanser türleri dahil olmak üzere çok çeşitli sağlık sorunlarına sahip olabilir. Hipotiroidizm başka bir yaygın sağlık sorunudur.
Kanser ve hipotiroidi vakaları boksör köpekler için belirgin hastalıklardır. Köpeklerde kardiyomiyopati düzensiz kalp atışlarına neden olan bir kalp hastalığıdır.
Spinal kordun dejeneratif myelopatisi, spinal kord kılıfının kırıldığı ilerleyici, tedavi edilemez bir hastalık gibi nörolojik sorunlar da görülebilir.
Yaygın olarak tüm köpek ırklarında bulunan diğer boksör köpekleri, uygun diyet ve ilaçlarla kolayca kontrol edilebilen alerjileri ve şişleri içerir.