Bakterilerin incelenmesi, bakteriyoloji adı verilen bir mikrobiyoloji dalının konusudur. Bakteriyoloji, deniz ve endüstriyel bakteriyoloji gibi belirli ortamlardaki bakterilere odaklanan birkaç alt bölüme ayrılmıştır.
Mikroskobun ortaya çıkışıyla, bilim adamları bakteri denilen organizmaları incelemeye başladı. 1853-1872 arasında Ferdinand Cohn birçok bakteri morfolojisini sınıflandırdı. Bununla birlikte, bakteri ve fermantasyon ve hastalık süreçleri arasında bağlantı kuran bilim adamları Robert Koch ve Louis Pasteur'un eseridir. Bakterilerin neden olduğu hastalıklarla mücadele etmek için ilaçların geliştirilmesi, immünoloji olarak bilinen tıp dalının kurulmasına neden olmuştur.
