Anomerik karbon, anomerlerin üzerinde döndüğü karbondur. Açık zincirde bulunan karbonil karbon, kristalize yapıdaki anomerik karbon haline gelir, ki bu da halkada bulunan en iyotlu karbondur. Anomerik karbona bağlı grubun oryantasyonuna bağlı olarak, ketoz karbonhidratlar ve siklize aldoz, a veya b anomerik konfigürasyonunu alabilir, Emory Üniversitesi'ni belirtir.
Anomerik karbon, bir elektronegatifin ekvator oryantasyonunun aksine eksenel bir oryantasyonda olması tercihi olan anomerik etki olarak bilinen bir özelliğe sahiptir. Bu açıklama ayrıca karbonhidratları, asiklik sistemi ve doymuş heterosiklleri de içermektedir. Anomerik pozisyondaki elektronegatifin eksenel performans gösterici olarak var olduğu bilinmektedir. Buna anomerik etki denir. Biology Online'a göre, anomerik bir karbonun iyi bir örneği, üzerinde dönmenin gerçekleştiği glukoz gibi monosakaritte bulunan karbondur. Çoğu durumda anomerik karbon, iki oksijen atomuna bağlı ve tekli bağlarla birleştirilen bir karbon atomu ile tanımlanabilir. Bu rotasyonun sonucu iki farklı konfigürasyondur, bir alfa ve bir beta. Bu haliyle, karbonhidratlar, genellikle mutarotasyon olarak adlandırılan bir işlem olan alfa ve beta konfigürasyonları arasında kendiliğinden değişebilmektedir.
