Doktorlar, enine miyelitin kesin nedenini bilmezler, ancak durum Ulusal Nörolojik Bozukluklar ve İnme Enstitüsü'ne göre, genellikle enfeksiyondan sonra veya başka bir durumun komplikasyonu olarak ortaya çıkar. Transvers miyelit aynı zamanda bazı hastalarda altta yatan merkezi sinir sistemi bozukluğunun ilk belirtisidir ve durumun bazı vakaları kanser tarafından tetiklenen anormal bir immün yanıtın bir sonucudur.
Transvers miyelit, Lyme hastalığının, suçiçeği aşılarının, sifilizin ve kızamığın bir komplikasyonu olarak ortaya çıkabilir, Ulusal Nörolojik Bozukluklar ve İnme Enstitüsü'nü not eder. Duruma yol açabilecek viral enfeksiyonlar arasında suçiçeği zoster, Epstein-Barr, herpes simpleks, hepatit A ve grip bulunur. Orta kulak enfeksiyonları gibi bakteriyel enfeksiyonlar da transvers miyelite yol açabilir. Transvers miyelitli bazı hastalarda sarkoidoz ve Sjorgren sendromu gibi otoimmün bir hastalık vardır.
Multipl skleroz veya nöromyelitis optika olan hastalar bazen semptom olarak transvers miyelit yaşar, Ulusal Nörolojik Bozukluklar ve İnme Enstitüsü'nü açıklar. Multipl sklerozda, transvers miyelit semptomu genellikle omuriliğin sadece bir kısmını etkiler. Nöromyelitis optika hastaları ise, tüm omuriliği etkileyen hem görme kaybı hem de enine miyelit yaşarlar.