Sürüngen kalpleri, büyük ölçüde amfibi kalplerine benzer, üç bölmelidir ve biri oksijenli kan alan diğeri akciğerlerden deoksijenli kan alan iki atriyumu ile oksijenli ve deoksijenli kanın orta düzeyde ayrılmasını sağlar. Sürüngen kalbin ventrikülü hala oksijenli ve oksijensiz kanın birbirine karışmasına izin verir, bu da bir memeli kalbi kadar sağlam veya verimli olmadığı anlamına gelir.
Kanın ayrılması, kanın gelişmesinin atriyumdan bağımsız olarak zamanlanması nedeniyle oluşur. Her iki atriyuma kan aynı anda gelirse, karışım olur, ancak bu hayvanın vücut sıcaklığına ve aktivite durumuna bağlı olarak daha büyük veya daha düşük bir dereceye kadar olabilir.
Kan conus arteriosus'a ulaştığında, dolaşım sistemine giriş olan truncus arteriosus'un üç kanalını aşağı çeker ve daha sonra sürüngen vücudunun geri kalanı boyunca hareket eder. Konüs üç ayrı sisteme, akciğer gövde sistemine ve sol ve sağ sistemik gövde sistemlerine yol açar.
Memeli kalpleri sürekli aktivite ve yüksek hareket ve efor düzeylerine yöneliktir, sürüngen kalpleri ise kısa patlamalarda daha iyi performans gösterir ve hayvanın sık sık dinlenmesini ve vücut ısısını kontrol etmek için çalışmasını gerektirir. Düşük kan oksijeni seviyeleri sürüngenlerin halsiz kalmasına ve yatmaya yatkın olmasına neden olur.
